1 介绍
1.1 主要特性和优点
Molo Pipeline 致力于构建标准化空间多组学分析范式，通过集成化分析框架实现从数据预处理、基础分析到可视化呈现的全流程覆盖。其智能化操作界面与优化算法显著提升分析效率与结果可重复性，有效降低对编程基础与工具学习成本的要求。
Molo Pipeline的核心特性和技术优势体现为：
- 简易性：免配置环境与编程学习，核心分析功能封装为单行命令，支持零代码交互式操作；
- 高效性：采用并行化计算框架与智能化资源分配策略，实现超线性时间复杂度的数据处理；
- 精确性：集成经同行评审的权威算法框架，建立全流程质量控制系统保障结果生物学意义；
- 自动化：构建标准化分析路径，全流程批处理系统支持一键式生成可发表级分析报告；
- 完备性：全面覆盖空间转录组、蛋白组等多模态数据分析需求，持续更新前沿分析方法；
- 兼容性：建立标准化数据接口体系，支持与Seurat、Scanpy(anndata)、Voyager、CellChat、Monocle3(CDS)等平台对象的无损转换；
- 扩展性：基于模块化架构设计，支持自定义分析流程与算法插件开发，创新性实现R语言生态与PyTorch框架的深度耦合；
- 可视化：预置Nature/Cell级可视化模板库，自动生成多维动态交互图表，满足从数据探索到出版级制图的全阶段需求。